Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB5BP61020 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB5BP61020 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB5BP61020 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB5BP61020 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB5BP61020 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB5BP61020 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB5BP61020 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB5BP61020 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB5BP61020 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB5BP61020 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB5BP61020 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB5BP61020 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB5BP61020 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB5BP61020 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB5BP61020 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB5BP61020 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB5BP61020 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB5BP61020 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB5BP61020 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB5BP61020 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB5BP61020 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB5BP61020 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB5BP61020 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB5BP61020 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB5BP61020 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB5BP61020 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB5BP61020 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB5BP61020 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB5BP61020 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB5BP61020 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB5BP61020 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB5BP61020 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB5BP61020 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB5BP61020 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB5BP61020 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB5BP61020 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB5BP61020 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB5BP61020 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB5BP61020 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB5BP61020 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB5BP61020 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB5BP61020 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB5BP61020 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB5BP61020 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB5BP61020 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB5BP61020 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB5BP61020 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB5BP61020 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB5BP61020 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB5BP61020 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB5BP61020 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB5BP61020 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB5BP61020 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB5BP61020 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB5BP61020 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB5BP61020 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB5BP61020 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB5BP61020 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB5BP61020 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB5BP61020 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB5BP61020 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB5BP61020 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB5BP61020 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB5BP61020 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB5BP61020 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB5BP61020 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB5BP61020 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB5BP61020 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB5BP61020 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB5BP61020 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB5BP61020 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB5BP61020 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB5BP61020 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB5BP61020 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB5BP61020 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB5BP61020 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB5BP61020 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB5BP61020 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB5BP61020 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms