Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB38P57729 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB38P57729 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB38P57729 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB38P57729 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB38P57729 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB38P57729 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB38P57729 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB38P57729 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB38P57729 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB38P57729 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB38P57729 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB38P57729 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB38P57729 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB38P57729 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB38P57729 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB38P57729 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB38P57729 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB38P57729 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB38P57729 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB38P57729 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB38P57729 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB38P57729 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB38P57729 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB38P57729 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB38P57729 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB38P57729 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB38P57729 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB38P57729 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB38P57729 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB38P57729 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB38P57729 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB38P57729 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB38P57729 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB38P57729 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB38P57729 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB38P57729 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB38P57729 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB38P57729 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB38P57729 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB38P57729 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB38P57729 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB38P57729 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB38P57729 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB38P57729 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB38P57729 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB38P57729 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB38P57729 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB38P57729 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB38P57729 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB38P57729 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB38P57729 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB38P57729 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB38P57729 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB38P57729 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB38P57729 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB38P57729 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB38P57729 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB38P57729 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB38P57729 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
RAB38P57729 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB38P57729 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB38P57729 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB38P57729 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB38P57729 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB38P57729 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB38P57729 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB38P57729 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB38P57729 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB38P57729 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB38P57729 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB38P57729 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB38P57729 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB38P57729 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB38P57729 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB38P57729 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB38P57729 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB38P57729 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB38P57729 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB38P57729 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB38P57729 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB38P57729 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB38P57729 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB38P57729 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB38P57729 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB38P57729 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB38P57729 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB38P57729 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB38P57729 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB38P57729 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB38P57729 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB38P57729 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB38P57729 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB38P57729 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB38P57729 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB38P57729 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB38P57729 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB38P57729 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB38P57729 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB38P57729 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms