Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GEMIN4P57678 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GEMIN4P57678 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GEMIN4P57678 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GEMIN4P57678 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GEMIN4P57678 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GEMIN4P57678 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GEMIN4P57678 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GEMIN4P57678 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GEMIN4P57678 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GEMIN4P57678 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GEMIN4P57678 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GEMIN4P57678 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GEMIN4P57678 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GEMIN4P57678 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GEMIN4P57678 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GEMIN4P57678 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GEMIN4P57678 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GEMIN4P57678 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GEMIN4P57678 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GEMIN4P57678 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GEMIN4P57678 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GEMIN4P57678 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GEMIN4P57678 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GEMIN4P57678 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GEMIN4P57678 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GEMIN4P57678 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GEMIN4P57678 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GEMIN4P57678 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GEMIN4P57678 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GEMIN4P57678 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GEMIN4P57678 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GEMIN4P57678 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GEMIN4P57678 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GEMIN4P57678 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GEMIN4P57678 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GEMIN4P57678 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GEMIN4P57678 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GEMIN4P57678 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GEMIN4P57678 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GEMIN4P57678 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GEMIN4P57678 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GEMIN4P57678 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GEMIN4P57678 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GEMIN4P57678 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GEMIN4P57678 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GEMIN4P57678 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GEMIN4P57678 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GEMIN4P57678 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GEMIN4P57678 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GEMIN4P57678 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GEMIN4P57678 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GEMIN4P57678 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GEMIN4P57678 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GEMIN4P57678 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GEMIN4P57678 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GEMIN4P57678 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GEMIN4P57678 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GEMIN4P57678 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GEMIN4P57678 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GEMIN4P57678 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GEMIN4P57678 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GEMIN4P57678 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GEMIN4P57678 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GEMIN4P57678 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GEMIN4P57678 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GEMIN4P57678 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GEMIN4P57678 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GEMIN4P57678 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GEMIN4P57678 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GEMIN4P57678 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GEMIN4P57678 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GEMIN4P57678 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GEMIN4P57678 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GEMIN4P57678 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GEMIN4P57678 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GEMIN4P57678 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GEMIN4P57678 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GEMIN4P57678 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GEMIN4P57678 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GEMIN4P57678 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GEMIN4P57678 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GEMIN4P57678 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GEMIN4P57678 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms