Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GPC3P51654 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GPC3P51654 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GPC3P51654 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GPC3P51654 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GPC3P51654 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GPC3P51654 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GPC3P51654 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GPC3P51654 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GPC3P51654 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GPC3P51654 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GPC3P51654 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GPC3P51654 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GPC3P51654 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GPC3P51654 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GPC3P51654 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GPC3P51654 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GPC3P51654 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GPC3P51654 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GPC3P51654 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GPC3P51654 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GPC3P51654 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPC3P51654 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GPC3P51654 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPC3P51654 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPC3P51654 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPC3P51654 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPC3P51654 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPC3P51654 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
GPC3P51654 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GPC3P51654 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPC3P51654 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GPC3P51654 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GPC3P51654 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPC3P51654 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPC3P51654 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GPC3P51654 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GPC3P51654 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
GPC3P51654 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GPC3P51654 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GPC3P51654 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPC3P51654 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPC3P51654 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPC3P51654 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPC3P51654 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
GPC3P51654 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPC3P51654 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPC3P51654 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPC3P51654 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GPC3P51654 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GPC3P51654 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPC3P51654 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPC3P51654 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPC3P51654 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPC3P51654 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPC3P51654 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GPC3P51654 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GPC3P51654 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPC3P51654 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPC3P51654 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GPC3P51654 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GPC3P51654 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPC3P51654 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPC3P51654 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GPC3P51654 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPC3P51654 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GPC3P51654 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPC3P51654 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GPC3P51654 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPC3P51654 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GPC3P51654 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPC3P51654 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPC3P51654 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPC3P51654 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPC3P51654 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPC3P51654 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPC3P51654 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPC3P51654 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPC3P51654 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPC3P51654 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPC3P51654 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPC3P51654 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPC3P51654 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPC3P51654 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GPC3P51654 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GPC3P51654 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GPC3P51654 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GPC3P51654 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GPC3P51654 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GPC3P51654 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPC3P51654 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPC3P51654 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPC3P51654 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GPC3P51654 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GPC3P51654 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GPC3P51654 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPC3P51654 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GPC3P51654 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPC3P51654 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPC3P51654 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms