Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
MRE11P49959 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MRE11P49959 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
MRE11P49959 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
MRE11P49959 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
MRE11P49959 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
MRE11P49959 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MRE11P49959 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MRE11P49959 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MRE11P49959 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MRE11P49959 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MRE11P49959 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
MRE11P49959 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MRE11P49959 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
MRE11P49959 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MRE11P49959 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MRE11P49959 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MRE11P49959 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MRE11P49959 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MRE11P49959 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MRE11P49959 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MRE11P49959 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MRE11P49959 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MRE11P49959 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MRE11P49959 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
MRE11P49959 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
MRE11P49959 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MRE11P49959 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MRE11P49959 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MRE11P49959 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MRE11P49959 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MRE11P49959 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MRE11P49959 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MRE11P49959 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MRE11P49959 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MRE11P49959 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MRE11P49959 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MRE11P49959 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
MRE11P49959 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MRE11P49959 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MRE11P49959 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MRE11P49959 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MRE11P49959 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MRE11P49959 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MRE11P49959 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MRE11P49959 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MRE11P49959 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MRE11P49959 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MRE11P49959 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MRE11P49959 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MRE11P49959 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MRE11P49959 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MRE11P49959 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MRE11P49959 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MRE11P49959 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MRE11P49959 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
MRE11P49959 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
MRE11P49959 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
MRE11P49959 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
MRE11P49959 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
MRE11P49959 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MRE11P49959 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MRE11P49959 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
MRE11P49959 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MRE11P49959 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MRE11P49959 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
MRE11P49959 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
MRE11P49959 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MRE11P49959 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MRE11P49959 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MRE11P49959 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MRE11P49959 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MRE11P49959 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MRE11P49959 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MRE11P49959 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MRE11P49959 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MRE11P49959 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MRE11P49959 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MRE11P49959 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
MRE11P49959 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MRE11P49959 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MRE11P49959 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MRE11P49959 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MRE11P49959 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MRE11P49959 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MRE11P49959 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MRE11P49959 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MRE11P49959 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MRE11P49959 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
MRE11P49959 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MRE11P49959 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MRE11P49959 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
MRE11P49959 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MRE11P49959 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MRE11P49959 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MRE11P49959 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MRE11P49959 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MRE11P49959 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MRE11P49959 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MRE11P49959 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms