Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM3P40198 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM3P40198 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM3P40198 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM3P40198 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM3P40198 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM3P40198 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM3P40198 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM3P40198 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM3P40198 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM3P40198 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM3P40198 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM3P40198 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM3P40198 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM3P40198 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM3P40198 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEACAM3P40198 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM3P40198 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM3P40198 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM3P40198 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEACAM3P40198 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM3P40198 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CEACAM3P40198 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM3P40198 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM3P40198 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEACAM3P40198 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM3P40198 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEACAM3P40198 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEACAM3P40198 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEACAM3P40198 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEACAM3P40198 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEACAM3P40198 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEACAM3P40198 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEACAM3P40198 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEACAM3P40198 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEACAM3P40198 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEACAM3P40198 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEACAM3P40198 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CEACAM3P40198 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEACAM3P40198 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms