Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RCVRNP35243 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RCVRNP35243 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCVRNP35243 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCVRNP35243 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RCVRNP35243 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCVRNP35243 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCVRNP35243 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCVRNP35243 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCVRNP35243 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCVRNP35243 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCVRNP35243 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCVRNP35243 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCVRNP35243 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCVRNP35243 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCVRNP35243 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCVRNP35243 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCVRNP35243 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCVRNP35243 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCVRNP35243 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCVRNP35243 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCVRNP35243 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCVRNP35243 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCVRNP35243 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCVRNP35243 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCVRNP35243 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCVRNP35243 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCVRNP35243 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCVRNP35243 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCVRNP35243 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCVRNP35243 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCVRNP35243 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCVRNP35243 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCVRNP35243 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCVRNP35243 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCVRNP35243 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCVRNP35243 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCVRNP35243 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCVRNP35243 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCVRNP35243 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCVRNP35243 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCVRNP35243 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCVRNP35243 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCVRNP35243 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCVRNP35243 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCVRNP35243 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCVRNP35243 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCVRNP35243 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCVRNP35243 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCVRNP35243 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCVRNP35243 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCVRNP35243 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCVRNP35243 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCVRNP35243 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RCVRNP35243 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCVRNP35243 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCVRNP35243 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCVRNP35243 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCVRNP35243 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCVRNP35243 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCVRNP35243 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCVRNP35243 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCVRNP35243 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms