Protein–RNA interactions for Protein: P34059

GALNS, N-acetylgalactosamine-6-sulfatase, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNSP34059 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GALNSP34059 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GALNSP34059 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GALNSP34059 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GALNSP34059 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GALNSP34059 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GALNSP34059 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GALNSP34059 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GALNSP34059 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GALNSP34059 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GALNSP34059 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GALNSP34059 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GALNSP34059 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GALNSP34059 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GALNSP34059 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GALNSP34059 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GALNSP34059 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GALNSP34059 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GALNSP34059 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GALNSP34059 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GALNSP34059 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GALNSP34059 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GALNSP34059 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GALNSP34059 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GALNSP34059 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GALNSP34059 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GALNSP34059 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNSP34059 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GALNSP34059 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GALNSP34059 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GALNSP34059 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GALNSP34059 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GALNSP34059 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GALNSP34059 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNSP34059 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNSP34059 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNSP34059 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GALNSP34059 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GALNSP34059 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GALNSP34059 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GALNSP34059 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNSP34059 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNSP34059 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GALNSP34059 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GALNSP34059 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GALNSP34059 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GALNSP34059 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GALNSP34059 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GALNSP34059 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GALNSP34059 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GALNSP34059 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GALNSP34059 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GALNSP34059 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GALNSP34059 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GALNSP34059 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GALNSP34059 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GALNSP34059 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GALNSP34059 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GALNSP34059 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GALNSP34059 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GALNSP34059 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GALNSP34059 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GALNSP34059 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GALNSP34059 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GALNSP34059 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GALNSP34059 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GALNSP34059 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GALNSP34059 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GALNSP34059 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GALNSP34059 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GALNSP34059 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GALNSP34059 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GALNSP34059 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GALNSP34059 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GALNSP34059 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GALNSP34059 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GALNSP34059 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GALNSP34059 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GALNSP34059 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNSP34059 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNSP34059 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNSP34059 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNSP34059 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNSP34059 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNSP34059 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GALNSP34059 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GALNSP34059 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GALNSP34059 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GALNSP34059 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GALNSP34059 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GALNSP34059 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GALNSP34059 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GALNSP34059 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GALNSP34059 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GALNSP34059 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GALNSP34059 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GALNSP34059 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GALNSP34059 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GALNSP34059 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GALNSP34059 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms