Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRIP30626 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRIP30626 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRIP30626 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRIP30626 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRIP30626 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRIP30626 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRIP30626 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRIP30626 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRIP30626 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRIP30626 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRIP30626 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRIP30626 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRIP30626 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRIP30626 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRIP30626 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRIP30626 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRIP30626 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRIP30626 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRIP30626 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRIP30626 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SRIP30626 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRIP30626 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRIP30626 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRIP30626 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRIP30626 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRIP30626 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRIP30626 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRIP30626 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRIP30626 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRIP30626 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRIP30626 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRIP30626 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRIP30626 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRIP30626 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRIP30626 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRIP30626 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRIP30626 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRIP30626 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRIP30626 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRIP30626 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRIP30626 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRIP30626 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRIP30626 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRIP30626 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRIP30626 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRIP30626 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRIP30626 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRIP30626 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRIP30626 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SRIP30626 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRIP30626 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRIP30626 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRIP30626 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRIP30626 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRIP30626 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRIP30626 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRIP30626 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRIP30626 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRIP30626 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRIP30626 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRIP30626 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRIP30626 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRIP30626 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRIP30626 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRIP30626 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRIP30626 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRIP30626 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRIP30626 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRIP30626 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRIP30626 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRIP30626 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRIP30626 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRIP30626 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRIP30626 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRIP30626 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRIP30626 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRIP30626 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRIP30626 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRIP30626 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRIP30626 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SRIP30626 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRIP30626 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRIP30626 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRIP30626 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRIP30626 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRIP30626 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRIP30626 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRIP30626 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRIP30626 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRIP30626 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRIP30626 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRIP30626 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRIP30626 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRIP30626 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRIP30626 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRIP30626 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRIP30626 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRIP30626 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRIP30626 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms