Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APCP25054 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APCP25054 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APCP25054 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APCP25054 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APCP25054 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
APCP25054 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APCP25054 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APCP25054 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APCP25054 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APCP25054 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APCP25054 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APCP25054 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APCP25054 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APCP25054 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APCP25054 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
APCP25054 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APCP25054 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APCP25054 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APCP25054 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APCP25054 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APCP25054 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APCP25054 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APCP25054 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APCP25054 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APCP25054 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APCP25054 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APCP25054 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APCP25054 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APCP25054 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APCP25054 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APCP25054 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APCP25054 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APCP25054 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APCP25054 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APCP25054 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APCP25054 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APCP25054 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APCP25054 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APCP25054 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APCP25054 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APCP25054 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APCP25054 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APCP25054 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APCP25054 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APCP25054 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APCP25054 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APCP25054 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APCP25054 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APCP25054 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APCP25054 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APCP25054 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APCP25054 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APCP25054 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APCP25054 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APCP25054 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APCP25054 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APCP25054 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APCP25054 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APCP25054 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APCP25054 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APCP25054 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APCP25054 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APCP25054 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APCP25054 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APCP25054 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APCP25054 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APCP25054 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APCP25054 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APCP25054 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APCP25054 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APCP25054 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APCP25054 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APCP25054 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APCP25054 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APCP25054 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APCP25054 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APCP25054 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APCP25054 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APCP25054 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APCP25054 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APCP25054 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APCP25054 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APCP25054 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APCP25054 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APCP25054 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APCP25054 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APCP25054 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APCP25054 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APCP25054 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APCP25054 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APCP25054 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APCP25054 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APCP25054 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APCP25054 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APCP25054 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APCP25054 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APCP25054 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APCP25054 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APCP25054 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms