Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBG1P23258 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBG1P23258 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBG1P23258 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBG1P23258 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBG1P23258 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBG1P23258 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBG1P23258 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBG1P23258 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBG1P23258 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBG1P23258 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBG1P23258 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBG1P23258 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBG1P23258 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBG1P23258 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBG1P23258 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBG1P23258 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBG1P23258 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBG1P23258 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBG1P23258 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBG1P23258 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBG1P23258 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBG1P23258 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBG1P23258 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBG1P23258 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBG1P23258 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms