Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF3P20783 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTF3P20783 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTF3P20783 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTF3P20783 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTF3P20783 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTF3P20783 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTF3P20783 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTF3P20783 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NTF3P20783 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NTF3P20783 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTF3P20783 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTF3P20783 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTF3P20783 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTF3P20783 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTF3P20783 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTF3P20783 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTF3P20783 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTF3P20783 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTF3P20783 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTF3P20783 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTF3P20783 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTF3P20783 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTF3P20783 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTF3P20783 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTF3P20783 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTF3P20783 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NTF3P20783 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NTF3P20783 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NTF3P20783 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NTF3P20783 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTF3P20783 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTF3P20783 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTF3P20783 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTF3P20783 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTF3P20783 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTF3P20783 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTF3P20783 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF3P20783 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF3P20783 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF3P20783 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF3P20783 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF3P20783 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF3P20783 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF3P20783 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTF3P20783 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTF3P20783 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTF3P20783 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTF3P20783 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTF3P20783 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF3P20783 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF3P20783 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF3P20783 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF3P20783 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF3P20783 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTF3P20783 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTF3P20783 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTF3P20783 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTF3P20783 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTF3P20783 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NTF3P20783 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTF3P20783 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTF3P20783 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTF3P20783 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTF3P20783 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTF3P20783 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTF3P20783 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTF3P20783 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NTF3P20783 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTF3P20783 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF3P20783 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF3P20783 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTF3P20783 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTF3P20783 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTF3P20783 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTF3P20783 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTF3P20783 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTF3P20783 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTF3P20783 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTF3P20783 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTF3P20783 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTF3P20783 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTF3P20783 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTF3P20783 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTF3P20783 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NTF3P20783 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTF3P20783 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTF3P20783 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF3P20783 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF3P20783 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF3P20783 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTF3P20783 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTF3P20783 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTF3P20783 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTF3P20783 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTF3P20783 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTF3P20783 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTF3P20783 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF3P20783 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF3P20783 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms