Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTPS1P17812 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTPS1P17812 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTPS1P17812 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTPS1P17812 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTPS1P17812 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTPS1P17812 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTPS1P17812 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CTPS1P17812 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CTPS1P17812 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTPS1P17812 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTPS1P17812 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTPS1P17812 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTPS1P17812 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CTPS1P17812 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTPS1P17812 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTPS1P17812 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTPS1P17812 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTPS1P17812 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTPS1P17812 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTPS1P17812 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTPS1P17812 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTPS1P17812 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTPS1P17812 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTPS1P17812 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTPS1P17812 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTPS1P17812 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTPS1P17812 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTPS1P17812 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTPS1P17812 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTPS1P17812 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTPS1P17812 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTPS1P17812 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTPS1P17812 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTPS1P17812 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTPS1P17812 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTPS1P17812 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTPS1P17812 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTPS1P17812 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTPS1P17812 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTPS1P17812 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTPS1P17812 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTPS1P17812 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTPS1P17812 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTPS1P17812 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTPS1P17812 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTPS1P17812 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTPS1P17812 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTPS1P17812 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTPS1P17812 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTPS1P17812 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTPS1P17812 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTPS1P17812 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTPS1P17812 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTPS1P17812 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CTPS1P17812 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTPS1P17812 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTPS1P17812 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTPS1P17812 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms