Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB1P14653 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB1P14653 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXB1P14653 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXB1P14653 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB1P14653 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB1P14653 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB1P14653 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB1P14653 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB1P14653 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB1P14653 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB1P14653 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB1P14653 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB1P14653 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB1P14653 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB1P14653 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB1P14653 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB1P14653 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB1P14653 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB1P14653 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB1P14653 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB1P14653 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB1P14653 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB1P14653 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB1P14653 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB1P14653 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB1P14653 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB1P14653 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB1P14653 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB1P14653 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB1P14653 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB1P14653 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB1P14653 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB1P14653 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB1P14653 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB1P14653 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB1P14653 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB1P14653 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB1P14653 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB1P14653 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB1P14653 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXB1P14653 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB1P14653 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB1P14653 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB1P14653 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB1P14653 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB1P14653 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB1P14653 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB1P14653 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB1P14653 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB1P14653 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB1P14653 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB1P14653 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB1P14653 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB1P14653 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB1P14653 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB1P14653 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB1P14653 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB1P14653 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB1P14653 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB1P14653 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB1P14653 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB1P14653 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB1P14653 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB1P14653 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB1P14653 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB1P14653 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB1P14653 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB1P14653 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB1P14653 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB1P14653 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB1P14653 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB1P14653 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB1P14653 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB1P14653 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB1P14653 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB1P14653 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB1P14653 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB1P14653 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB1P14653 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB1P14653 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB1P14653 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXB1P14653 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXB1P14653 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB1P14653 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB1P14653 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB1P14653 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB1P14653 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB1P14653 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB1P14653 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB1P14653 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB1P14653 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB1P14653 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB1P14653 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB1P14653 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB1P14653 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB1P14653 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB1P14653 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB1P14653 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB1P14653 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms