Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DMDP11532 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DMDP11532 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DMDP11532 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DMDP11532 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DMDP11532 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DMDP11532 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DMDP11532 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DMDP11532 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DMDP11532 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DMDP11532 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DMDP11532 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DMDP11532 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DMDP11532 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DMDP11532 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DMDP11532 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DMDP11532 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DMDP11532 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DMDP11532 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DMDP11532 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DMDP11532 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DMDP11532 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DMDP11532 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DMDP11532 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DMDP11532 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DMDP11532 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DMDP11532 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DMDP11532 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DMDP11532 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DMDP11532 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DMDP11532 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
DMDP11532 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DMDP11532 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DMDP11532 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DMDP11532 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DMDP11532 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DMDP11532 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DMDP11532 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DMDP11532 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DMDP11532 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DMDP11532 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DMDP11532 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
DMDP11532 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DMDP11532 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DMDP11532 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DMDP11532 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DMDP11532 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DMDP11532 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DMDP11532 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DMDP11532 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DMDP11532 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DMDP11532 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DMDP11532 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DMDP11532 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DMDP11532 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DMDP11532 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DMDP11532 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DMDP11532 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DMDP11532 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DMDP11532 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DMDP11532 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DMDP11532 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DMDP11532 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DMDP11532 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DMDP11532 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DMDP11532 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DMDP11532 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DMDP11532 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DMDP11532 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DMDP11532 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DMDP11532 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DMDP11532 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DMDP11532 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DMDP11532 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DMDP11532 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DMDP11532 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DMDP11532 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DMDP11532 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DMDP11532 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DMDP11532 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DMDP11532 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DMDP11532 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DMDP11532 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DMDP11532 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DMDP11532 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DMDP11532 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DMDP11532 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DMDP11532 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DMDP11532 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DMDP11532 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DMDP11532 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DMDP11532 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DMDP11532 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DMDP11532 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DMDP11532 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
DMDP11532 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DMDP11532 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DMDP11532 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DMDP11532 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DMDP11532 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms