Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
U2AF1L5P0DN76 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
U2AF1L5P0DN76 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
U2AF1L5P0DN76 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
U2AF1L5P0DN76 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
U2AF1L5P0DN76 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
U2AF1L5P0DN76 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
U2AF1L5P0DN76 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
U2AF1L5P0DN76 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
U2AF1L5P0DN76 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
U2AF1L5P0DN76 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
U2AF1L5P0DN76 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
U2AF1L5P0DN76 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
U2AF1L5P0DN76 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
U2AF1L5P0DN76 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
U2AF1L5P0DN76 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
U2AF1L5P0DN76 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
U2AF1L5P0DN76 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
U2AF1L5P0DN76 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
U2AF1L5P0DN76 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
U2AF1L5P0DN76 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
U2AF1L5P0DN76 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
U2AF1L5P0DN76 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
U2AF1L5P0DN76 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
U2AF1L5P0DN76 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
U2AF1L5P0DN76 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
U2AF1L5P0DN76 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
U2AF1L5P0DN76 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
U2AF1L5P0DN76 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
U2AF1L5P0DN76 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
U2AF1L5P0DN76 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
U2AF1L5P0DN76 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
U2AF1L5P0DN76 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
U2AF1L5P0DN76 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
U2AF1L5P0DN76 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
U2AF1L5P0DN76 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
U2AF1L5P0DN76 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
U2AF1L5P0DN76 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
U2AF1L5P0DN76 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
U2AF1L5P0DN76 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
U2AF1L5P0DN76 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
U2AF1L5P0DN76 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
U2AF1L5P0DN76 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
U2AF1L5P0DN76 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
U2AF1L5P0DN76 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
U2AF1L5P0DN76 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
U2AF1L5P0DN76 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
U2AF1L5P0DN76 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
U2AF1L5P0DN76 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
U2AF1L5P0DN76 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
U2AF1L5P0DN76 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
U2AF1L5P0DN76 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
U2AF1L5P0DN76 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.34
U2AF1L5P0DN76 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
U2AF1L5P0DN76 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
U2AF1L5P0DN76 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
U2AF1L5P0DN76 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
U2AF1L5P0DN76 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
U2AF1L5P0DN76 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
U2AF1L5P0DN76 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
U2AF1L5P0DN76 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
U2AF1L5P0DN76 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
U2AF1L5P0DN76 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
U2AF1L5P0DN76 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
U2AF1L5P0DN76 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
U2AF1L5P0DN76 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
U2AF1L5P0DN76 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
U2AF1L5P0DN76 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
U2AF1L5P0DN76 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
U2AF1L5P0DN76 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
U2AF1L5P0DN76 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
U2AF1L5P0DN76 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
U2AF1L5P0DN76 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
U2AF1L5P0DN76 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
U2AF1L5P0DN76 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
U2AF1L5P0DN76 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
U2AF1L5P0DN76 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
U2AF1L5P0DN76 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
U2AF1L5P0DN76 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
U2AF1L5P0DN76 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
U2AF1L5P0DN76 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
U2AF1L5P0DN76 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms