Protein–RNA interactions for Protein: P07992

ERCC1, DNA excision repair protein ERCC-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC1P07992 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC1P07992 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC1P07992 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC1P07992 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC1P07992 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC1P07992 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC1P07992 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC1P07992 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC1P07992 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERCC1P07992 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERCC1P07992 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERCC1P07992 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ERCC1P07992 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERCC1P07992 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERCC1P07992 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERCC1P07992 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERCC1P07992 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERCC1P07992 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERCC1P07992 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERCC1P07992 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERCC1P07992 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERCC1P07992 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERCC1P07992 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC1P07992 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC1P07992 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC1P07992 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC1P07992 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC1P07992 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC1P07992 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC1P07992 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC1P07992 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC1P07992 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC1P07992 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC1P07992 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERCC1P07992 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC1P07992 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC1P07992 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC1P07992 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC1P07992 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC1P07992 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC1P07992 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC1P07992 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC1P07992 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC1P07992 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC1P07992 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC1P07992 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC1P07992 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC1P07992 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC1P07992 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC1P07992 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC1P07992 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC1P07992 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC1P07992 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC1P07992 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC1P07992 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC1P07992 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC1P07992 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC1P07992 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC1P07992 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC1P07992 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC1P07992 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC1P07992 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC1P07992 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC1P07992 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC1P07992 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC1P07992 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC1P07992 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC1P07992 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC1P07992 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC1P07992 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC1P07992 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC1P07992 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC1P07992 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC1P07992 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC1P07992 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC1P07992 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC1P07992 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC1P07992 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC1P07992 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC1P07992 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC1P07992 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC1P07992 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC1P07992 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms