Protein–RNA interactions for Protein: P03891

MT-ND2, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND2P03891 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MT-ND2P03891 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MT-ND2P03891 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MT-ND2P03891 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MT-ND2P03891 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MT-ND2P03891 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-ND2P03891 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-ND2P03891 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-ND2P03891 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-ND2P03891 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-ND2P03891 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-ND2P03891 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-ND2P03891 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-ND2P03891 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-ND2P03891 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MT-ND2P03891 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MT-ND2P03891 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MT-ND2P03891 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MT-ND2P03891 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MT-ND2P03891 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MT-ND2P03891 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MT-ND2P03891 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MT-ND2P03891 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MT-ND2P03891 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MT-ND2P03891 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MT-ND2P03891 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MT-ND2P03891 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MT-ND2P03891 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MT-ND2P03891 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MT-ND2P03891 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MT-ND2P03891 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MT-ND2P03891 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MT-ND2P03891 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND2P03891 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND2P03891 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND2P03891 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND2P03891 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND2P03891 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND2P03891 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MT-ND2P03891 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MT-ND2P03891 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MT-ND2P03891 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MT-ND2P03891 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MT-ND2P03891 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MT-ND2P03891 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MT-ND2P03891 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MT-ND2P03891 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MT-ND2P03891 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MT-ND2P03891 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MT-ND2P03891 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MT-ND2P03891 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MT-ND2P03891 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MT-ND2P03891 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MT-ND2P03891 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MT-ND2P03891 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MT-ND2P03891 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MT-ND2P03891 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MT-ND2P03891 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MT-ND2P03891 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MT-ND2P03891 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MT-ND2P03891 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MT-ND2P03891 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MT-ND2P03891 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MT-ND2P03891 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MT-ND2P03891 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MT-ND2P03891 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MT-ND2P03891 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MT-ND2P03891 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MT-ND2P03891 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MT-ND2P03891 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MT-ND2P03891 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MT-ND2P03891 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MT-ND2P03891 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MT-ND2P03891 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-ND2P03891 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-ND2P03891 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-ND2P03891 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-ND2P03891 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-ND2P03891 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MT-ND2P03891 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MT-ND2P03891 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MT-ND2P03891 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MT-ND2P03891 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MT-ND2P03891 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms