Protein–RNA interactions for Protein: P00395

MT-CO1, Cytochrome c oxidase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO1P00395 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MT-CO1P00395 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MT-CO1P00395 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MT-CO1P00395 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MT-CO1P00395 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MT-CO1P00395 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MT-CO1P00395 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MT-CO1P00395 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MT-CO1P00395 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MT-CO1P00395 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MT-CO1P00395 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MT-CO1P00395 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MT-CO1P00395 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MT-CO1P00395 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MT-CO1P00395 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MT-CO1P00395 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MT-CO1P00395 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MT-CO1P00395 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MT-CO1P00395 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MT-CO1P00395 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MT-CO1P00395 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MT-CO1P00395 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MT-CO1P00395 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MT-CO1P00395 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MT-CO1P00395 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MT-CO1P00395 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MT-CO1P00395 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MT-CO1P00395 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MT-CO1P00395 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MT-CO1P00395 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MT-CO1P00395 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MT-CO1P00395 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MT-CO1P00395 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MT-CO1P00395 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MT-CO1P00395 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MT-CO1P00395 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MT-CO1P00395 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MT-CO1P00395 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MT-CO1P00395 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MT-CO1P00395 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MT-CO1P00395 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MT-CO1P00395 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MT-CO1P00395 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MT-CO1P00395 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MT-CO1P00395 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MT-CO1P00395 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MT-CO1P00395 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MT-CO1P00395 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
MT-CO1P00395 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MT-CO1P00395 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MT-CO1P00395 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MT-CO1P00395 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MT-CO1P00395 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MT-CO1P00395 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MT-CO1P00395 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MT-CO1P00395 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MT-CO1P00395 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MT-CO1P00395 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MT-CO1P00395 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MT-CO1P00395 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MT-CO1P00395 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MT-CO1P00395 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MT-CO1P00395 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MT-CO1P00395 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MT-CO1P00395 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MT-CO1P00395 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MT-CO1P00395 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MT-CO1P00395 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MT-CO1P00395 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MT-CO1P00395 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MT-CO1P00395 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MT-CO1P00395 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MT-CO1P00395 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MT-CO1P00395 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MT-CO1P00395 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MT-CO1P00395 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MT-CO1P00395 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MT-CO1P00395 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MT-CO1P00395 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MT-CO1P00395 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MT-CO1P00395 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MT-CO1P00395 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MT-CO1P00395 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MT-CO1P00395 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MT-CO1P00395 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MT-CO1P00395 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MT-CO1P00395 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MT-CO1P00395 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MT-CO1P00395 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MT-CO1P00395 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MT-CO1P00395 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MT-CO1P00395 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MT-CO1P00395 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MT-CO1P00395 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MT-CO1P00395 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MT-CO1P00395 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MT-CO1P00395 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MT-CO1P00395 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MT-CO1P00395 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MT-CO1P00395 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms