Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP29O95721 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP29O95721 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP29O95721 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP29O95721 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP29O95721 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP29O95721 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP29O95721 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP29O95721 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP29O95721 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP29O95721 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP29O95721 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP29O95721 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP29O95721 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP29O95721 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP29O95721 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP29O95721 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP29O95721 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP29O95721 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP29O95721 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP29O95721 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP29O95721 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP29O95721 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP29O95721 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP29O95721 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP29O95721 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP29O95721 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP29O95721 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP29O95721 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP29O95721 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP29O95721 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP29O95721 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP29O95721 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP29O95721 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP29O95721 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP29O95721 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP29O95721 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP29O95721 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP29O95721 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP29O95721 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP29O95721 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP29O95721 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP29O95721 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP29O95721 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP29O95721 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP29O95721 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP29O95721 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP29O95721 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP29O95721 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP29O95721 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP29O95721 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP29O95721 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP29O95721 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP29O95721 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP29O95721 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP29O95721 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP29O95721 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP29O95721 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP29O95721 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP29O95721 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP29O95721 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP29O95721 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP29O95721 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP29O95721 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP29O95721 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP29O95721 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP29O95721 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP29O95721 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNAP29O95721 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNAP29O95721 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP29O95721 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP29O95721 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP29O95721 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP29O95721 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP29O95721 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP29O95721 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms