Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGR4O95473 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGR4O95473 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGR4O95473 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGR4O95473 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNGR4O95473 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNGR4O95473 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNGR4O95473 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNGR4O95473 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNGR4O95473 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNGR4O95473 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNGR4O95473 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNGR4O95473 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNGR4O95473 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNGR4O95473 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNGR4O95473 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNGR4O95473 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNGR4O95473 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNGR4O95473 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNGR4O95473 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNGR4O95473 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGR4O95473 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGR4O95473 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGR4O95473 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGR4O95473 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNGR4O95473 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNGR4O95473 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNGR4O95473 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNGR4O95473 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGR4O95473 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGR4O95473 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNGR4O95473 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNGR4O95473 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNGR4O95473 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNGR4O95473 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNGR4O95473 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNGR4O95473 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGR4O95473 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGR4O95473 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNGR4O95473 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGR4O95473 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGR4O95473 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGR4O95473 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNGR4O95473 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNGR4O95473 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGR4O95473 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGR4O95473 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGR4O95473 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGR4O95473 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGR4O95473 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGR4O95473 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGR4O95473 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGR4O95473 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGR4O95473 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGR4O95473 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGR4O95473 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGR4O95473 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGR4O95473 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGR4O95473 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGR4O95473 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGR4O95473 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNGR4O95473 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGR4O95473 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms