Protein–RNA interactions for Protein: O76070

SNCG, Gamma-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCGO76070 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCGO76070 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCGO76070 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCGO76070 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCGO76070 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCGO76070 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCGO76070 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCGO76070 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCGO76070 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCGO76070 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCGO76070 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCGO76070 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCGO76070 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCGO76070 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCGO76070 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCGO76070 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCGO76070 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCGO76070 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCGO76070 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCGO76070 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCGO76070 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCGO76070 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCGO76070 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCGO76070 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCGO76070 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCGO76070 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCGO76070 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCGO76070 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCGO76070 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNCGO76070 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCGO76070 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCGO76070 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCGO76070 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCGO76070 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCGO76070 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNCGO76070 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCGO76070 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNCGO76070 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCGO76070 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCGO76070 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCGO76070 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCGO76070 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCGO76070 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCGO76070 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCGO76070 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCGO76070 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCGO76070 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNCGO76070 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCGO76070 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCGO76070 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCGO76070 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCGO76070 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCGO76070 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCGO76070 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCGO76070 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCGO76070 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCGO76070 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCGO76070 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCGO76070 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCGO76070 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCGO76070 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNCGO76070 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCGO76070 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCGO76070 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNCGO76070 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNCGO76070 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCGO76070 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCGO76070 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCGO76070 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCGO76070 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCGO76070 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCGO76070 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCGO76070 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCGO76070 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCGO76070 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCGO76070 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCGO76070 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCGO76070 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCGO76070 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCGO76070 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCGO76070 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCGO76070 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNCGO76070 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNCGO76070 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCGO76070 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCGO76070 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCGO76070 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCGO76070 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCGO76070 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCGO76070 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCGO76070 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCGO76070 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCGO76070 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCGO76070 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCGO76070 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCGO76070 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCGO76070 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCGO76070 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCGO76070 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCGO76070 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms