Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLPXO76031 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPXO76031 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLPXO76031 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPXO76031 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPXO76031 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPXO76031 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPXO76031 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPXO76031 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPXO76031 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPXO76031 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPXO76031 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPXO76031 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLPXO76031 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLPXO76031 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPXO76031 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPXO76031 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPXO76031 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPXO76031 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLPXO76031 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPXO76031 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPXO76031 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPXO76031 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPXO76031 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLPXO76031 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLPXO76031 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLPXO76031 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPXO76031 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPXO76031 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLPXO76031 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPXO76031 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPXO76031 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPXO76031 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLPXO76031 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLPXO76031 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLPXO76031 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CLPXO76031 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLPXO76031 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPXO76031 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPXO76031 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPXO76031 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPXO76031 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPXO76031 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPXO76031 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPXO76031 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPXO76031 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLPXO76031 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLPXO76031 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLPXO76031 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLPXO76031 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLPXO76031 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLPXO76031 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLPXO76031 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLPXO76031 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLPXO76031 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLPXO76031 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLPXO76031 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLPXO76031 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPXO76031 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPXO76031 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPXO76031 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPXO76031 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPXO76031 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPXO76031 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPXO76031 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPXO76031 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPXO76031 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPXO76031 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPXO76031 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPXO76031 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPXO76031 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPXO76031 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPXO76031 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPXO76031 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLPXO76031 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLPXO76031 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLPXO76031 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLPXO76031 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPXO76031 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPXO76031 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPXO76031 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLPXO76031 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLPXO76031 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLPXO76031 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLPXO76031 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLPXO76031 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLPXO76031 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLPXO76031 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLPXO76031 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLPXO76031 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLPXO76031 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLPXO76031 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLPXO76031 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLPXO76031 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLPXO76031 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLPXO76031 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLPXO76031 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLPXO76031 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPXO76031 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPXO76031 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms