Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASSF9O75901 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASSF9O75901 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASSF9O75901 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASSF9O75901 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASSF9O75901 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASSF9O75901 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RASSF9O75901 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASSF9O75901 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASSF9O75901 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASSF9O75901 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASSF9O75901 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASSF9O75901 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms