Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRDM1O75626 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM1O75626 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM1O75626 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRDM1O75626 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM1O75626 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM1O75626 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM1O75626 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM1O75626 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM1O75626 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRDM1O75626 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PRDM1O75626 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRDM1O75626 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM1O75626 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRDM1O75626 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM1O75626 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM1O75626 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM1O75626 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM1O75626 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM1O75626 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRDM1O75626 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRDM1O75626 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM1O75626 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM1O75626 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM1O75626 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PRDM1O75626 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRDM1O75626 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRDM1O75626 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM1O75626 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM1O75626 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM1O75626 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM1O75626 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PRDM1O75626 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRDM1O75626 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRDM1O75626 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PRDM1O75626 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PRDM1O75626 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PRDM1O75626 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRDM1O75626 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
PRDM1O75626 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRDM1O75626 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM1O75626 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM1O75626 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM1O75626 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRDM1O75626 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PRDM1O75626 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PRDM1O75626 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM1O75626 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PRDM1O75626 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRDM1O75626 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRDM1O75626 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM1O75626 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRDM1O75626 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRDM1O75626 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRDM1O75626 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRDM1O75626 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PRDM1O75626 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM1O75626 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM1O75626 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRDM1O75626 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRDM1O75626 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PRDM1O75626 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM1O75626 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM1O75626 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM1O75626 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM1O75626 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM1O75626 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM1O75626 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM1O75626 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRDM1O75626 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM1O75626 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM1O75626 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM1O75626 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM1O75626 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRDM1O75626 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRDM1O75626 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM1O75626 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRDM1O75626 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRDM1O75626 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
PRDM1O75626 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PRDM1O75626 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM1O75626 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRDM1O75626 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM1O75626 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDM1O75626 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM1O75626 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM1O75626 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM1O75626 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM1O75626 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRDM1O75626 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM1O75626 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
PRDM1O75626 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM1O75626 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRDM1O75626 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM1O75626 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM1O75626 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRDM1O75626 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM1O75626 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM1O75626 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRDM1O75626 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms