Protein–RNA interactions for Protein: O75394

MRPL33, 39S ribosomal protein L33, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL33O75394 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL33O75394 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL33O75394 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL33O75394 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL33O75394 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL33O75394 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL33O75394 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL33O75394 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL33O75394 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL33O75394 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL33O75394 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL33O75394 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL33O75394 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL33O75394 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL33O75394 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL33O75394 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL33O75394 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL33O75394 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL33O75394 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL33O75394 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL33O75394 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL33O75394 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL33O75394 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL33O75394 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL33O75394 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL33O75394 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL33O75394 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL33O75394 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL33O75394 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL33O75394 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL33O75394 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL33O75394 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL33O75394 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL33O75394 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL33O75394 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL33O75394 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL33O75394 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL33O75394 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL33O75394 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL33O75394 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL33O75394 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL33O75394 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL33O75394 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL33O75394 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL33O75394 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL33O75394 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL33O75394 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL33O75394 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL33O75394 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL33O75394 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL33O75394 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL33O75394 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL33O75394 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL33O75394 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL33O75394 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL33O75394 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL33O75394 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL33O75394 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL33O75394 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL33O75394 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL33O75394 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL33O75394 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL33O75394 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL33O75394 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL33O75394 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL33O75394 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL33O75394 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL33O75394 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL33O75394 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL33O75394 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL33O75394 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL33O75394 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL33O75394 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL33O75394 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL33O75394 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL33O75394 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL33O75394 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL33O75394 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL33O75394 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL33O75394 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL33O75394 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL33O75394 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL33O75394 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL33O75394 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms