Protein–RNA interactions for Protein: O60673

REV3L, DNA polymerase zeta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 3,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV3LO60673 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
REV3LO60673 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
REV3LO60673 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
REV3LO60673 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
REV3LO60673 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
REV3LO60673 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
REV3LO60673 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
REV3LO60673 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
REV3LO60673 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
REV3LO60673 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
REV3LO60673 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
REV3LO60673 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
REV3LO60673 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
REV3LO60673 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
REV3LO60673 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
REV3LO60673 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
REV3LO60673 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
REV3LO60673 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
REV3LO60673 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
REV3LO60673 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
REV3LO60673 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
REV3LO60673 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
REV3LO60673 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
REV3LO60673 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
REV3LO60673 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
REV3LO60673 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
REV3LO60673 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
REV3LO60673 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
REV3LO60673 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
REV3LO60673 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
REV3LO60673 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
REV3LO60673 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
REV3LO60673 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
REV3LO60673 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
REV3LO60673 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
REV3LO60673 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
REV3LO60673 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
REV3LO60673 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
REV3LO60673 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
REV3LO60673 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
REV3LO60673 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
REV3LO60673 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
REV3LO60673 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
REV3LO60673 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
REV3LO60673 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
REV3LO60673 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
REV3LO60673 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
REV3LO60673 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
REV3LO60673 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
REV3LO60673 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
REV3LO60673 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
REV3LO60673 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
REV3LO60673 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
REV3LO60673 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
REV3LO60673 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
REV3LO60673 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
REV3LO60673 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
REV3LO60673 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
REV3LO60673 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
REV3LO60673 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
REV3LO60673 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
REV3LO60673 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
REV3LO60673 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
REV3LO60673 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
REV3LO60673 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
REV3LO60673 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
REV3LO60673 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
REV3LO60673 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
REV3LO60673 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
REV3LO60673 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
REV3LO60673 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
REV3LO60673 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
REV3LO60673 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
REV3LO60673 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
REV3LO60673 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
REV3LO60673 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
REV3LO60673 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
REV3LO60673 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
REV3LO60673 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
REV3LO60673 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
REV3LO60673 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
REV3LO60673 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
REV3LO60673 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
REV3LO60673 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
REV3LO60673 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
REV3LO60673 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
REV3LO60673 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
REV3LO60673 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
REV3LO60673 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
REV3LO60673 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
REV3LO60673 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
REV3LO60673 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
REV3LO60673 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
REV3LO60673 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
REV3LO60673 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
REV3LO60673 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
REV3LO60673 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
REV3LO60673 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
REV3LO60673 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
REV3LO60673 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms