Protein–RNA interactions for Protein: O15266

SHOX, Short stature homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOXO15266 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHOXO15266 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOXO15266 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOXO15266 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOXO15266 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOXO15266 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOXO15266 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOXO15266 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOXO15266 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHOXO15266 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHOXO15266 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHOXO15266 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHOXO15266 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHOXO15266 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHOXO15266 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHOXO15266 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHOXO15266 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOXO15266 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOXO15266 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOXO15266 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOXO15266 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOXO15266 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOXO15266 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOXO15266 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOXO15266 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOXO15266 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOXO15266 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHOXO15266 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHOXO15266 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHOXO15266 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHOXO15266 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHOXO15266 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHOXO15266 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHOXO15266 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHOXO15266 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHOXO15266 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHOXO15266 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SHOXO15266 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHOXO15266 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHOXO15266 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHOXO15266 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHOXO15266 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHOXO15266 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHOXO15266 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHOXO15266 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHOXO15266 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOXO15266 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOXO15266 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOXO15266 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHOXO15266 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHOXO15266 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHOXO15266 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHOXO15266 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOXO15266 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOXO15266 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOXO15266 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOXO15266 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOXO15266 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOXO15266 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOXO15266 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOXO15266 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOXO15266 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOXO15266 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOXO15266 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOXO15266 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOXO15266 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOXO15266 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHOXO15266 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHOXO15266 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHOXO15266 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHOXO15266 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHOXO15266 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHOXO15266 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHOXO15266 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOXO15266 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOXO15266 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOXO15266 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOXO15266 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHOXO15266 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHOXO15266 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHOXO15266 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHOXO15266 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHOXO15266 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHOXO15266 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHOXO15266 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHOXO15266 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHOXO15266 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHOXO15266 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHOXO15266 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHOXO15266 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHOXO15266 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHOXO15266 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOXO15266 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOXO15266 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOXO15266 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOXO15266 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOXO15266 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOXO15266 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOXO15266 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHOXO15266 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms