Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
APAF1O14727 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
APAF1O14727 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
APAF1O14727 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
APAF1O14727 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
APAF1O14727 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
APAF1O14727 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
APAF1O14727 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
APAF1O14727 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
APAF1O14727 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
APAF1O14727 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
APAF1O14727 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
APAF1O14727 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
APAF1O14727 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
APAF1O14727 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
APAF1O14727 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
APAF1O14727 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
APAF1O14727 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
APAF1O14727 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
APAF1O14727 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
APAF1O14727 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
APAF1O14727 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
APAF1O14727 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
APAF1O14727 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
APAF1O14727 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
APAF1O14727 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
APAF1O14727 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
APAF1O14727 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
APAF1O14727 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
APAF1O14727 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
APAF1O14727 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
APAF1O14727 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
APAF1O14727 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
APAF1O14727 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
APAF1O14727 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
APAF1O14727 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
APAF1O14727 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
APAF1O14727 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
APAF1O14727 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
APAF1O14727 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
APAF1O14727 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
APAF1O14727 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
APAF1O14727 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
APAF1O14727 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
APAF1O14727 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
APAF1O14727 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
APAF1O14727 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
APAF1O14727 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
APAF1O14727 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
APAF1O14727 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
APAF1O14727 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
APAF1O14727 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
APAF1O14727 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
APAF1O14727 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
APAF1O14727 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
APAF1O14727 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
APAF1O14727 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
APAF1O14727 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
APAF1O14727 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
APAF1O14727 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
APAF1O14727 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
APAF1O14727 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
APAF1O14727 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
APAF1O14727 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
APAF1O14727 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
APAF1O14727 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
APAF1O14727 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
APAF1O14727 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
APAF1O14727 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
APAF1O14727 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
APAF1O14727 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
APAF1O14727 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
APAF1O14727 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
APAF1O14727 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
APAF1O14727 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
APAF1O14727 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
APAF1O14727 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
APAF1O14727 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
APAF1O14727 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
APAF1O14727 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
APAF1O14727 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
APAF1O14727 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
APAF1O14727 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
APAF1O14727 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
APAF1O14727 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
APAF1O14727 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
APAF1O14727 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
APAF1O14727 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
APAF1O14727 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
APAF1O14727 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
APAF1O14727 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
APAF1O14727 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
APAF1O14727 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
APAF1O14727 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
APAF1O14727 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
APAF1O14727 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
APAF1O14727 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
APAF1O14727 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
APAF1O14727 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
APAF1O14727 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms