Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
APAF1O14727 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
APAF1O14727 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
APAF1O14727 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
APAF1O14727 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
APAF1O14727 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
APAF1O14727 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
APAF1O14727 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
APAF1O14727 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
APAF1O14727 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
APAF1O14727 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
APAF1O14727 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
APAF1O14727 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
APAF1O14727 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
APAF1O14727 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
APAF1O14727 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
APAF1O14727 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
APAF1O14727 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
APAF1O14727 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
APAF1O14727 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
APAF1O14727 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
APAF1O14727 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
APAF1O14727 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
APAF1O14727 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
APAF1O14727 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
APAF1O14727 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
APAF1O14727 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
APAF1O14727 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
APAF1O14727 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
APAF1O14727 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
APAF1O14727 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
APAF1O14727 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
APAF1O14727 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
APAF1O14727 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
APAF1O14727 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
APAF1O14727 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
APAF1O14727 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
APAF1O14727 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
APAF1O14727 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
APAF1O14727 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
APAF1O14727 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
APAF1O14727 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
APAF1O14727 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
APAF1O14727 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
APAF1O14727 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
APAF1O14727 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
APAF1O14727 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
APAF1O14727 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
APAF1O14727 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
APAF1O14727 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
APAF1O14727 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
APAF1O14727 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
APAF1O14727 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
APAF1O14727 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
APAF1O14727 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
APAF1O14727 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
APAF1O14727 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
APAF1O14727 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
APAF1O14727 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
APAF1O14727 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
APAF1O14727 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
APAF1O14727 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
APAF1O14727 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
APAF1O14727 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
APAF1O14727 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
APAF1O14727 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
APAF1O14727 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
APAF1O14727 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
APAF1O14727 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
APAF1O14727 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
APAF1O14727 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
APAF1O14727 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
APAF1O14727 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
APAF1O14727 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
APAF1O14727 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
APAF1O14727 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
APAF1O14727 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
APAF1O14727 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
APAF1O14727 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
APAF1O14727 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
APAF1O14727 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
APAF1O14727 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
APAF1O14727 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
APAF1O14727 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
APAF1O14727 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
APAF1O14727 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
APAF1O14727 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
APAF1O14727 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
APAF1O14727 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
APAF1O14727 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
APAF1O14727 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
APAF1O14727 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
APAF1O14727 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
APAF1O14727 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
APAF1O14727 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
APAF1O14727 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
APAF1O14727 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
APAF1O14727 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
APAF1O14727 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
APAF1O14727 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms