Protein–RNA interactions for Protein: O14646

CHD1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1O14646 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.1■■■■■ 4.97
CHD1O14646 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
CHD1O14646 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC46.08■■■■■ 4.97
CHD1O14646 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC46.06■■■■■ 4.96
CHD1O14646 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
CHD1O14646 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
CHD1O14646 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC45.99■■■■■ 4.95
CHD1O14646 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.99■■■■■ 4.95
CHD1O14646 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
CHD1O14646 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
CHD1O14646 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
CHD1O14646 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC45.95■■■■■ 4.95
CHD1O14646 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
CHD1O14646 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
CHD1O14646 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
CHD1O14646 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC45.92■■■■■ 4.94
CHD1O14646 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
CHD1O14646 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
CHD1O14646 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC45.89■■■■■ 4.94
CHD1O14646 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC45.88■■■■■ 4.93
CHD1O14646 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC45.86■■■■■ 4.93
CHD1O14646 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC45.84■■■■■ 4.93
CHD1O14646 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC45.83■■■■■ 4.93
CHD1O14646 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
CHD1O14646 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
CHD1O14646 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC45.8■■■■■ 4.92
CHD1O14646 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
CHD1O14646 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC45.8■■■■■ 4.92
CHD1O14646 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC45.8■■■■■ 4.92
CHD1O14646 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
CHD1O14646 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC45.77■■■■■ 4.92
CHD1O14646 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
CHD1O14646 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC45.72■■■■■ 4.91
CHD1O14646 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC45.71■■■■■ 4.91
CHD1O14646 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.7■■■■■ 4.91
CHD1O14646 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
CHD1O14646 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
CHD1O14646 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
CHD1O14646 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
CHD1O14646 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
CHD1O14646 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
CHD1O14646 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC45.66■■■■■ 4.9
CHD1O14646 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC45.66■■■■■ 4.9
CHD1O14646 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
CHD1O14646 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
CHD1O14646 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
CHD1O14646 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
CHD1O14646 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
CHD1O14646 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
CHD1O14646 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
CHD1O14646 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
CHD1O14646 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC45.53■■■■■ 4.88
CHD1O14646 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
CHD1O14646 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
CHD1O14646 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
CHD1O14646 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
CHD1O14646 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
CHD1O14646 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
CHD1O14646 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
CHD1O14646 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
CHD1O14646 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
CHD1O14646 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
CHD1O14646 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
CHD1O14646 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
CHD1O14646 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
CHD1O14646 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC45.43■■■■■ 4.86
CHD1O14646 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
CHD1O14646 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
CHD1O14646 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
CHD1O14646 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC45.4■■■■■ 4.86
CHD1O14646 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
CHD1O14646 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
CHD1O14646 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
CHD1O14646 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
CHD1O14646 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
CHD1O14646 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
CHD1O14646 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
CHD1O14646 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.84
CHD1O14646 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
CHD1O14646 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
CHD1O14646 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
CHD1O14646 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
CHD1O14646 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
CHD1O14646 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CHD1O14646 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC45.28■■■■■ 4.84
CHD1O14646 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
CHD1O14646 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CHD1O14646 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC45.27■■■■■ 4.84
CHD1O14646 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
CHD1O14646 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
CHD1O14646 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
CHD1O14646 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
CHD1O14646 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC45.25■■■■■ 4.83
CHD1O14646 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC45.24■■■■■ 4.83
CHD1O14646 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
CHD1O14646 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CHD1O14646 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
CHD1O14646 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
CHD1O14646 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
CHD1O14646 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms