Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
SUPT5HO00267 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.92■■■■■ 5.42
SUPT5HO00267 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC48.9■■■■■ 5.42
SUPT5HO00267 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC48.9■■■■■ 5.42
SUPT5HO00267 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
SUPT5HO00267 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
SUPT5HO00267 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
SUPT5HO00267 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC48.86■■■■■ 5.41
SUPT5HO00267 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
SUPT5HO00267 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
SUPT5HO00267 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
SUPT5HO00267 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
SUPT5HO00267 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC48.82■■■■■ 5.41
SUPT5HO00267 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
SUPT5HO00267 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
SUPT5HO00267 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC48.76■■■■■ 5.4
SUPT5HO00267 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
SUPT5HO00267 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
SUPT5HO00267 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC48.75■■■■■ 5.39
SUPT5HO00267 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
SUPT5HO00267 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
SUPT5HO00267 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC48.68■■■■■ 5.38
SUPT5HO00267 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
SUPT5HO00267 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC48.67■■■■■ 5.38
SUPT5HO00267 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
SUPT5HO00267 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC48.65■■■■■ 5.38
SUPT5HO00267 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC48.65■■■■■ 5.38
SUPT5HO00267 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC48.63■■■■■ 5.38
SUPT5HO00267 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
SUPT5HO00267 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC48.6■■■■■ 5.37
SUPT5HO00267 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC48.6■■■■■ 5.37
SUPT5HO00267 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
SUPT5HO00267 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
SUPT5HO00267 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC48.56■■■■■ 5.36
SUPT5HO00267 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC48.55■■■■■ 5.36
SUPT5HO00267 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.55■■■■■ 5.36
SUPT5HO00267 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC48.53■■■■■ 5.36
SUPT5HO00267 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
SUPT5HO00267 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
SUPT5HO00267 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
SUPT5HO00267 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
SUPT5HO00267 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
SUPT5HO00267 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC48.44■■■■■ 5.34
SUPT5HO00267 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC48.44■■■■■ 5.34
SUPT5HO00267 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.34
SUPT5HO00267 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
SUPT5HO00267 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC48.43■■■■■ 5.34
SUPT5HO00267 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
SUPT5HO00267 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC48.41■■■■■ 5.34
SUPT5HO00267 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC48.41■■■■■ 5.34
SUPT5HO00267 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
SUPT5HO00267 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
SUPT5HO00267 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
SUPT5HO00267 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
SUPT5HO00267 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
SUPT5HO00267 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
SUPT5HO00267 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC48.33■■■■■ 5.33
SUPT5HO00267 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.32■■■■■ 5.33
SUPT5HO00267 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
SUPT5HO00267 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
SUPT5HO00267 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
SUPT5HO00267 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC48.29■■■■■ 5.32
SUPT5HO00267 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
SUPT5HO00267 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC48.28■■■■■ 5.32
SUPT5HO00267 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.27■■■■■ 5.32
SUPT5HO00267 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
SUPT5HO00267 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
SUPT5HO00267 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC48.24■■■■■ 5.31
SUPT5HO00267 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC48.24■■■■■ 5.31
SUPT5HO00267 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
SUPT5HO00267 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
SUPT5HO00267 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
SUPT5HO00267 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
SUPT5HO00267 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC48.22■■■■■ 5.31
SUPT5HO00267 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC48.22■■■■■ 5.31
SUPT5HO00267 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
SUPT5HO00267 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
SUPT5HO00267 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.19■■■■■ 5.31
SUPT5HO00267 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
SUPT5HO00267 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC48.17■■■■■ 5.3
SUPT5HO00267 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.16■■■■■ 5.3
SUPT5HO00267 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.16■■■■■ 5.3
SUPT5HO00267 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.15■■■■■ 5.3
SUPT5HO00267 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
SUPT5HO00267 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC48.13■■■■■ 5.3
SUPT5HO00267 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.29
SUPT5HO00267 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC48.12■■■■■ 5.29
SUPT5HO00267 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.12■■■■■ 5.29
SUPT5HO00267 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
SUPT5HO00267 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
SUPT5HO00267 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC48.11■■■■■ 5.29
SUPT5HO00267 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
SUPT5HO00267 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
SUPT5HO00267 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
SUPT5HO00267 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
SUPT5HO00267 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
SUPT5HO00267 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.07■■■■■ 5.29
SUPT5HO00267 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC48.07■■■■■ 5.29
SUPT5HO00267 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
SUPT5HO00267 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.04■■■■■ 5.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms