Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC179H3BU77 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC179H3BU77 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC179H3BU77 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC179H3BU77 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC179H3BU77 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms