Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG7

Transmembrane 9 superfamily member (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMG7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3BMG7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3BMG7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3BMG7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3BMG7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3BMG7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3BMG7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3BMG7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H3BMG7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3BMG7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3BMG7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3BMG7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3BMG7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3BMG7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3BMG7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3BMG7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3BMG7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3BMG7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3BMG7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BMG7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BMG7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BMG7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BMG7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMG7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMG7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMG7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMG7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMG7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMG7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMG7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3BMG7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3BMG7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3BMG7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3BMG7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BMG7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BMG7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BMG7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BMG7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H3BMG7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H3BMG7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H3BMG7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H3BMG7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H3BMG7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H3BMG7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H3BMG7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H3BMG7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3BMG7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3BMG7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3BMG7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
H3BMG7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3BMG7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3BMG7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3BMG7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3BMG7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3BMG7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H3BMG7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H3BMG7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H3BMG7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H3BMG7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H3BMG7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H3BMG7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H3BMG7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H3BMG7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H3BMG7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H3BMG7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H3BMG7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H3BMG7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BMG7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BMG7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BMG7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BMG7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BMG7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BMG7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BMG7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BMG7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BMG7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BMG7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BMG7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BMG7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BMG7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BMG7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BMG7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BMG7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BMG7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BMG7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BMG7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BMG7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BMG7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BMG7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BMG7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BMG7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3BMG7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3BMG7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3BMG7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BMG7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BMG7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BMG7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3BMG7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BMG7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BMG7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms