Protein–RNA interactions for Protein: G3V3Q6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3V3Q6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
G3V3Q6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
G3V3Q6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
G3V3Q6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
G3V3Q6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
G3V3Q6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
G3V3Q6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
G3V3Q6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
G3V3Q6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
G3V3Q6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
G3V3Q6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
G3V3Q6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
G3V3Q6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
G3V3Q6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
G3V3Q6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
G3V3Q6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
G3V3Q6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
G3V3Q6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
G3V3Q6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
G3V3Q6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
G3V3Q6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
G3V3Q6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
G3V3Q6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
G3V3Q6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
G3V3Q6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
G3V3Q6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
G3V3Q6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
G3V3Q6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
G3V3Q6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
G3V3Q6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
G3V3Q6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
G3V3Q6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
G3V3Q6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
G3V3Q6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
G3V3Q6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
G3V3Q6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
G3V3Q6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
G3V3Q6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
G3V3Q6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
G3V3Q6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
G3V3Q6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
G3V3Q6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
G3V3Q6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
G3V3Q6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
G3V3Q6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
G3V3Q6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
G3V3Q6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
G3V3Q6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
G3V3Q6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
G3V3Q6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
G3V3Q6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
G3V3Q6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
G3V3Q6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
G3V3Q6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
G3V3Q6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
G3V3Q6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
G3V3Q6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
G3V3Q6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
G3V3Q6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
G3V3Q6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
G3V3Q6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
G3V3Q6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
G3V3Q6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
G3V3Q6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
G3V3Q6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
G3V3Q6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
G3V3Q6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
G3V3Q6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
G3V3Q6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
G3V3Q6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
G3V3Q6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
G3V3Q6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
G3V3Q6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
G3V3Q6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
G3V3Q6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
G3V3Q6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
G3V3Q6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
G3V3Q6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
G3V3Q6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
G3V3Q6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
G3V3Q6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
G3V3Q6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
G3V3Q6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
G3V3Q6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
G3V3Q6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
G3V3Q6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
G3V3Q6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
G3V3Q6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
G3V3Q6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
G3V3Q6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
G3V3Q6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
G3V3Q6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
G3V3Q6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
G3V3Q6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
G3V3Q6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
G3V3Q6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
G3V3Q6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
G3V3Q6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
G3V3Q6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
G3V3Q6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms