Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJE1A6NN92 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJE1A6NN92 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GJE1A6NN92 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJE1A6NN92 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJE1A6NN92 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJE1A6NN92 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJE1A6NN92 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJE1A6NN92 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJE1A6NN92 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJE1A6NN92 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GJE1A6NN92 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJE1A6NN92 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJE1A6NN92 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJE1A6NN92 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJE1A6NN92 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJE1A6NN92 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJE1A6NN92 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJE1A6NN92 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJE1A6NN92 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJE1A6NN92 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJE1A6NN92 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJE1A6NN92 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJE1A6NN92 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJE1A6NN92 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJE1A6NN92 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJE1A6NN92 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJE1A6NN92 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJE1A6NN92 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJE1A6NN92 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GJE1A6NN92 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJE1A6NN92 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJE1A6NN92 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJE1A6NN92 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJE1A6NN92 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJE1A6NN92 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJE1A6NN92 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJE1A6NN92 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJE1A6NN92 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJE1A6NN92 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJE1A6NN92 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJE1A6NN92 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJE1A6NN92 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJE1A6NN92 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJE1A6NN92 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJE1A6NN92 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJE1A6NN92 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJE1A6NN92 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJE1A6NN92 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJE1A6NN92 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJE1A6NN92 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJE1A6NN92 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJE1A6NN92 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJE1A6NN92 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJE1A6NN92 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJE1A6NN92 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJE1A6NN92 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJE1A6NN92 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJE1A6NN92 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GJE1A6NN92 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJE1A6NN92 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJE1A6NN92 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJE1A6NN92 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GJE1A6NN92 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJE1A6NN92 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJE1A6NN92 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJE1A6NN92 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJE1A6NN92 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJE1A6NN92 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJE1A6NN92 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJE1A6NN92 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJE1A6NN92 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJE1A6NN92 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GJE1A6NN92 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJE1A6NN92 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJE1A6NN92 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJE1A6NN92 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJE1A6NN92 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJE1A6NN92 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJE1A6NN92 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJE1A6NN92 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJE1A6NN92 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJE1A6NN92 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms