Protein–RNA interactions for Protein: A6NGA9

TMEM202, Transmembrane protein 202, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM202A6NGA9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM202A6NGA9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM202A6NGA9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM202A6NGA9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM202A6NGA9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM202A6NGA9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM202A6NGA9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM202A6NGA9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM202A6NGA9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM202A6NGA9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM202A6NGA9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM202A6NGA9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM202A6NGA9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM202A6NGA9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM202A6NGA9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM202A6NGA9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM202A6NGA9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM202A6NGA9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM202A6NGA9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM202A6NGA9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM202A6NGA9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM202A6NGA9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM202A6NGA9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM202A6NGA9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM202A6NGA9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM202A6NGA9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM202A6NGA9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM202A6NGA9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM202A6NGA9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM202A6NGA9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM202A6NGA9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM202A6NGA9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM202A6NGA9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM202A6NGA9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM202A6NGA9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM202A6NGA9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM202A6NGA9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM202A6NGA9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM202A6NGA9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM202A6NGA9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM202A6NGA9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM202A6NGA9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM202A6NGA9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM202A6NGA9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM202A6NGA9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM202A6NGA9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM202A6NGA9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM202A6NGA9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM202A6NGA9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM202A6NGA9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM202A6NGA9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM202A6NGA9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM202A6NGA9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM202A6NGA9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM202A6NGA9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM202A6NGA9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM202A6NGA9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM202A6NGA9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM202A6NGA9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM202A6NGA9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM202A6NGA9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM202A6NGA9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM202A6NGA9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM202A6NGA9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM202A6NGA9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM202A6NGA9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM202A6NGA9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM202A6NGA9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM202A6NGA9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM202A6NGA9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM202A6NGA9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM202A6NGA9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM202A6NGA9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM202A6NGA9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM202A6NGA9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM202A6NGA9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM202A6NGA9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM202A6NGA9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM202A6NGA9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM202A6NGA9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM202A6NGA9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM202A6NGA9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms