Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA6L3A6NEY3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GOLGA6L3A6NEY3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GOLGA6L3A6NEY3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GOLGA6L3A6NEY3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GOLGA6L3A6NEY3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GOLGA6L3A6NEY3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GOLGA6L3A6NEY3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GOLGA6L3A6NEY3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GOLGA6L3A6NEY3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GOLGA6L3A6NEY3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
GOLGA6L3A6NEY3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GOLGA6L3A6NEY3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GOLGA6L3A6NEY3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GOLGA6L3A6NEY3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA6L3A6NEY3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA6L3A6NEY3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA6L3A6NEY3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GOLGA6L3A6NEY3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA6L3A6NEY3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA6L3A6NEY3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA6L3A6NEY3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA6L3A6NEY3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA6L3A6NEY3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GOLGA6L3A6NEY3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GOLGA6L3A6NEY3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GOLGA6L3A6NEY3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA6L3A6NEY3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA6L3A6NEY3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA6L3A6NEY3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GOLGA6L3A6NEY3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA6L3A6NEY3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA6L3A6NEY3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GOLGA6L3A6NEY3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
GOLGA6L3A6NEY3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GOLGA6L3A6NEY3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GOLGA6L3A6NEY3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA6L3A6NEY3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
GOLGA6L3A6NEY3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GOLGA6L3A6NEY3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GOLGA6L3A6NEY3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GOLGA6L3A6NEY3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GOLGA6L3A6NEY3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GOLGA6L3A6NEY3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
GOLGA6L3A6NEY3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GOLGA6L3A6NEY3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GOLGA6L3A6NEY3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GOLGA6L3A6NEY3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GOLGA6L3A6NEY3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GOLGA6L3A6NEY3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GOLGA6L3A6NEY3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GOLGA6L3A6NEY3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GOLGA6L3A6NEY3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GOLGA6L3A6NEY3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GOLGA6L3A6NEY3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA6L3A6NEY3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA6L3A6NEY3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA6L3A6NEY3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GOLGA6L3A6NEY3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA6L3A6NEY3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA6L3A6NEY3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA6L3A6NEY3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA6L3A6NEY3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA6L3A6NEY3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA6L3A6NEY3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA6L3A6NEY3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GOLGA6L3A6NEY3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA6L3A6NEY3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA6L3A6NEY3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GOLGA6L3A6NEY3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GOLGA6L3A6NEY3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GOLGA6L3A6NEY3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA6L3A6NEY3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA6L3A6NEY3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA6L3A6NEY3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA6L3A6NEY3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA6L3A6NEY3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA6L3A6NEY3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA6L3A6NEY3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA6L3A6NEY3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA6L3A6NEY3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA6L3A6NEY3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GOLGA6L3A6NEY3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GOLGA6L3A6NEY3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GOLGA6L3A6NEY3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA6L3A6NEY3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GOLGA6L3A6NEY3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GOLGA6L3A6NEY3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GOLGA6L3A6NEY3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms