Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCDC2BA2VCK2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCDC2BA2VCK2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCDC2BA2VCK2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCDC2BA2VCK2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCDC2BA2VCK2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCDC2BA2VCK2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCDC2BA2VCK2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCDC2BA2VCK2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCDC2BA2VCK2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCDC2BA2VCK2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCDC2BA2VCK2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCDC2BA2VCK2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DCDC2BA2VCK2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DCDC2BA2VCK2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DCDC2BA2VCK2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCDC2BA2VCK2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCDC2BA2VCK2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DCDC2BA2VCK2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCDC2BA2VCK2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCDC2BA2VCK2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCDC2BA2VCK2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DCDC2BA2VCK2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DCDC2BA2VCK2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCDC2BA2VCK2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCDC2BA2VCK2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCDC2BA2VCK2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCDC2BA2VCK2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DCDC2BA2VCK2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCDC2BA2VCK2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCDC2BA2VCK2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DCDC2BA2VCK2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DCDC2BA2VCK2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DCDC2BA2VCK2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCDC2BA2VCK2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCDC2BA2VCK2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCDC2BA2VCK2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCDC2BA2VCK2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCDC2BA2VCK2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCDC2BA2VCK2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCDC2BA2VCK2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCDC2BA2VCK2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCDC2BA2VCK2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCDC2BA2VCK2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCDC2BA2VCK2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCDC2BA2VCK2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCDC2BA2VCK2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCDC2BA2VCK2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCDC2BA2VCK2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCDC2BA2VCK2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCDC2BA2VCK2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCDC2BA2VCK2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCDC2BA2VCK2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCDC2BA2VCK2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCDC2BA2VCK2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCDC2BA2VCK2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DCDC2BA2VCK2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCDC2BA2VCK2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCDC2BA2VCK2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCDC2BA2VCK2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCDC2BA2VCK2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DCDC2BA2VCK2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DCDC2BA2VCK2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCDC2BA2VCK2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCDC2BA2VCK2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCDC2BA2VCK2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCDC2BA2VCK2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCDC2BA2VCK2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCDC2BA2VCK2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCDC2BA2VCK2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCDC2BA2VCK2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCDC2BA2VCK2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DCDC2BA2VCK2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCDC2BA2VCK2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCDC2BA2VCK2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCDC2BA2VCK2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCDC2BA2VCK2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DCDC2BA2VCK2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCDC2BA2VCK2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCDC2BA2VCK2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCDC2BA2VCK2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCDC2BA2VCK2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCDC2BA2VCK2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms