Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM199Q8N511 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM199Q8N511 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM199Q8N511 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM199Q8N511 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM199Q8N511 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM199Q8N511 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM199Q8N511 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms