Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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