Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPS4Q9NQG7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms