Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
LMOD2Q6P5Q4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD2Q6P5Q4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms