Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD20A3Q5VUR7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms