Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSPO2Q5TGU0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPO2Q5TGU0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms