Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
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