RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557420.1

RGMA-211, Transcript of repulsive guidance molecule BMP co-receptor a, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RGMA, Length 989 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMA-211ENST00000557420 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.92■■■■■ 5.74
RGMA-211ENST00000557420 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.69■■■■■ 4.9
RGMA-211ENST00000557420 ABCC9O60706 1549 aa45.43■■■■■ 4.86
RGMA-211ENST00000557420 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.43■■■■■ 4.54
RGMA-211ENST00000557420 NACADO15069 1562 aa43.17■■■■■ 4.5
RGMA-211ENST00000557420 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.93■■■■■ 4.46
RGMA-211ENST00000557420 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.66■■■■■ 4.42
RGMA-211ENST00000557420 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.44■■■■■ 4.38
RGMA-211ENST00000557420 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.36■■■■■ 4.37
RGMA-211ENST00000557420 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.31■■■■■ 4.36
RGMA-211ENST00000557420 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
RGMA-211ENST00000557420 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.14■■■■■ 4.34
RGMA-211ENST00000557420 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.05■■■■■ 4.32
RGMA-211ENST00000557420 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.66■■■■■ 4.26
RGMA-211ENST00000557420 SCRIBQ14160 1630 aa41.53■■■■■ 4.24
RGMA-211ENST00000557420 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.09■■■■■ 4.17
RGMA-211ENST00000557420 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
RGMA-211ENST00000557420 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.96■■■■■ 4.15
RGMA-211ENST00000557420 NCAPD3P42695 1498 aa39.83■■■■□ 3.97
RGMA-211ENST00000557420 SMARCA4P51532 1647 aa39.69■■■■□ 3.94
RGMA-211ENST00000557420 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.68■■■■□ 3.94
RGMA-211ENST00000557420 SMARCA2P51531 1590 aa39.65■■■■□ 3.94
RGMA-211ENST00000557420 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
RGMA-211ENST00000557420 HMGXB3Q12766 1538 aa39.55■■■■□ 3.92
RGMA-211ENST00000557420 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.34■■■■□ 3.89
RGMA-211ENST00000557420 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
RGMA-211ENST00000557420 ERCC6Q03468 1493 aa39.3■■■■□ 3.88
RGMA-211ENST00000557420 CUX2O14529 1486 aa39.21■■■■□ 3.87
RGMA-211ENST00000557420 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.18■■■■□ 3.86
RGMA-211ENST00000557420 NESP48681 1621 aa39.04■■■■□ 3.84
RGMA-211ENST00000557420 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39■■■■□ 3.83
RGMA-211ENST00000557420 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.93■■■■□ 3.82
RGMA-211ENST00000557420 WIZO95785 1651 aa38.73■■■■□ 3.79
RGMA-211ENST00000557420 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.72■■■■□ 3.79
RGMA-211ENST00000557420 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
RGMA-211ENST00000557420 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.63■■■■□ 3.77
RGMA-211ENST00000557420 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.59■■■■□ 3.77
RGMA-211ENST00000557420 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.46■■■■□ 3.75
RGMA-211ENST00000557420 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.32■■■■□ 3.72
RGMA-211ENST00000557420 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
RGMA-211ENST00000557420 WDR62O43379 1518 aa38.21■■■■□ 3.71
RGMA-211ENST00000557420 CFTRP13569 1480 aa38.21■■■■□ 3.71
RGMA-211ENST00000557420 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.21■■■■□ 3.71
RGMA-211ENST00000557420 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.15■■■■□ 3.7
RGMA-211ENST00000557420 PRDM2Q13029 1718 aa37.87■■■■□ 3.65
RGMA-211ENST00000557420 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.84■■■■□ 3.65
RGMA-211ENST00000557420 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
RGMA-211ENST00000557420 ABCC8Q09428 1581 aa37.51■■■■□ 3.59
RGMA-211ENST00000557420 OSCARQ8IYS5 282 aa37.47■■■■□ 3.59
RGMA-211ENST00000557420 IFT140Q96RY7 1462 aa37.45■■■■□ 3.59
RGMA-211ENST00000557420 TOPBP1Q92547 1522 aa37.44■■■■□ 3.58
RGMA-211ENST00000557420 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.34■■■■□ 3.57
RGMA-211ENST00000557420 TRIM41Q8WV44 630 aa37.3■■■■□ 3.56
RGMA-211ENST00000557420 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
RGMA-211ENST00000557420 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
RGMA-211ENST00000557420 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
RGMA-211ENST00000557420 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
RGMA-211ENST00000557420 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.99■■■■□ 3.51
RGMA-211ENST00000557420 SOGA1O94964 1423 aa36.93■■■■□ 3.5
RGMA-211ENST00000557420 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.88■■■■□ 3.5
RGMA-211ENST00000557420 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.86■■■■□ 3.49
RGMA-211ENST00000557420 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.86■■■■□ 3.49
RGMA-211ENST00000557420 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.86■■■■□ 3.49
RGMA-211ENST00000557420 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
RGMA-211ENST00000557420 WDR97A6NE52 1622 aa36.85■■■■□ 3.49
RGMA-211ENST00000557420 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.84■■■■□ 3.49
RGMA-211ENST00000557420 CHD1O14646 1710 aa36.82■■■■□ 3.48
RGMA-211ENST00000557420 CUX1P39880 1505 aa36.81■■■■□ 3.48
RGMA-211ENST00000557420 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
RGMA-211ENST00000557420 ARHGEF11O15085 1522 aa36.77■■■■□ 3.48
RGMA-211ENST00000557420 FBLN2P98095 1184 aa36.77■■■■□ 3.48
RGMA-211ENST00000557420 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.62■■■■□ 3.45
RGMA-211ENST00000557420 GRIN2BQ13224 1484 aa36.61■■■■□ 3.45
RGMA-211ENST00000557420 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
RGMA-211ENST00000557420 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
RGMA-211ENST00000557420 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.52■■■■□ 3.44
RGMA-211ENST00000557420 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.5■■■■□ 3.43
RGMA-211ENST00000557420 SYNJ2O15056 1496 aa36.47■■■■□ 3.43
RGMA-211ENST00000557420 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.47■■■■□ 3.43
RGMA-211ENST00000557420 SYNJ1O43426 1573 aa36.47■■■■□ 3.43
RGMA-211ENST00000557420 PBRM1Q86U86 1689 aa36.45■■■■□ 3.42
RGMA-211ENST00000557420 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.4■■■■□ 3.42
RGMA-211ENST00000557420 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.39■■■■□ 3.42
RGMA-211ENST00000557420 ARAP1Q96P48 1450 aa36.38■■■■□ 3.41
RGMA-211ENST00000557420 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.37■■■■□ 3.41
RGMA-211ENST00000557420 TOP2BQ02880 1626 aa36.32■■■■□ 3.4
RGMA-211ENST00000557420 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.32■■■■□ 3.4
RGMA-211ENST00000557420 GRIN2AQ12879 1464 aa36.11■■■■□ 3.37
RGMA-211ENST00000557420 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
RGMA-211ENST00000557420 ADAMTS12P58397 1594 aa36.07■■■■□ 3.37
RGMA-211ENST00000557420 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.05■■■■□ 3.36
RGMA-211ENST00000557420 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.05■■■■□ 3.36
RGMA-211ENST00000557420 NUP160Q12769 1436 aa35.98■■■■□ 3.35
RGMA-211ENST00000557420 CEP170Q5SW79 1584 aa35.92■■■■□ 3.34
RGMA-211ENST00000557420 SHROOM2Q13796 1616 aa35.8■■■■□ 3.32
RGMA-211ENST00000557420 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.76■■■■□ 3.32
RGMA-211ENST00000557420 JPH4Q96JJ6 628 aa35.66■■■■□ 3.3
RGMA-211ENST00000557420 KIF27Q86VH2 1401 aa35.66■■■■□ 3.3
RGMA-211ENST00000557420 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
RGMA-211ENST00000557420 IGF1RP08069 1367 aa35.58■■■■□ 3.29
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