Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCG1P45844 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms