Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC78A2IDD5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms