Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHA12Q9UN75 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms