Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms